Laboratoire de Physique Théorique
Toulouse - UMR 5152

Manoel MANGHI

Contact : manghi[at]irsamc.ups-tlse.fr

Address : Laboratoire de Physique Théorique, IRSAMC, Université Paul Sabatier, 118 Route de Narbonne, 31062 Toulouse Cedex 4, France

Office : 326 Bâtiment 3R1B4

Phone : +33 (0)5 61 55 61 77

Fax : +33 (0)5 61 55 60 65

Research Interests : Theoretical Soft Matter and Biophysics

 theory of charged complex liquids

• adsorption of polyelectrolytes from semi-dilute solutions [15]
• dependence of the persistence length of a flexible polyelectrolyte on the Debye length [9]
• dielectric exclusion near surfaces and in nanopores [19,21,22,34]
• liquid-vapor interface potential and ion solvation [25]
• conductance through hydrophobic nanopores [30,36]
• ANR project IONESCO Coupling between Ionic and Electronic Transport in Single-Walled Carbon Nanotubes

 modelisation of biological phenomena

• DNA denaturation [13,14,16,24] see highlight
• DNA bubble closure/nucleation dynamics [23,26,28] see the Review [33]
• statistical properties of DNA [17,24,32] see highlight
• DNA in the Tethered Particle Motion geometry : dynamics, curvature and salt dependence [20,29,31] see highlight1 highlight2
• biomimetism of flagellar hydrodynamics [10]
• fluctuation induced interactions between lipid domains in membranes [12,27]
• fluctuation induced interactions and hydrodynamics in double supported membranes [18]
• effect of recycling on nano domain formation [35]
• surface tension of biological membranes [37]

 low Reynolds number hydrodynamics

• propulsion by a rotating elastic semi-flexible filament [10] see highlight
• coupling between hydrodynamic interactions and elastic deformations [10,11]

 statistical physics of neutral polymers at interfaces

• variational approach describing the statistical physics of loops formed by adsorbed polymers on solid and fluid interfaces [7,8]
• variation of the surface tension of polymer melts and semi-dilute solutions vs. the polymerisation index. Comparison to experiments [1,2,4,5]
• polymer brushes on concave surfaces [3]
• polymer connectors mobile laterally [6]

My Google Scholar webpage

Highlights

 How salting DNA makes it more flexible and in french Comment saler l’adn le rend plus flexible
 Dependence of DNA Persistence Length on Ionic Strength of Solutions with Monovalent and Divalent Salts
 One of our recent articles [24] discussing DNA stretching by an applied force has been highlighted in epj.org.
 Why DNA denaturation bubble closure is so long ?
 Why DNA chains are "kinked" when observed on surfaces (DNA elastic properties on surfaces differ from ones in solution)
 DNA bubbles and bending : how conformational fluctuations modify its thermal denaturation
 How to reproduce bacterial propulsion in a biomimetic way ?

Thèse d’Habilitation à Diriger des Recherches (in french)
"Physique statistique d’objets biologiques et des électrolytes aux interfaces"

Ph.D. students

 Anil Kumar Dasanna (2010-2013) : currently in U. Schwarz group
Closure of DNA denaturation bubbles coupled to DNA elasticity
 Annaël Brunet (2012-2015) : Study of DNA conformational changes at the single molecule scale.
 Guillaume Gueguen (2013-2016) : Lipidic vesicles under tension : from mesophases to shape transitions.
 Julie Cornet (2017-2020) : Numerical study of lipidic vesicles.
 Théo Hennequin (2019-2022) : Coupling between Ionic and Electronic Transport in Single-Walled Carbon Nanotubes .

Administrative responsibilities/responsabilités administratives

 Membre élu du Comité national des Universités CNU section 29 - Constitutants élémentaires

 Membre élu de la Commission de la Recherche de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier
 Membre du Conseil Académique de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier
 Vice-président de la Section Disciplinaire de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier

 Membre du Département de Physique de de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier

Teaching/Enseignement

 Responsable du Master PFA-PV (Physique Fondamentale et Applications - Parcours Physique du Vivant , nouveau Master toulousain de physique du vivant correspondant à une refondation de l’ancien Master PCVS voir site PCVS.
Ce Master a pour but de former des étudiants de haut niveau en biophysique, physico-chimie, matière molle, physique de l’imagerie, physique des comportements sociétaux afin qu’ils soient en mesure d’appréhender des problèmes de biologie avec les outils de la physique. Ceux-ci sont maintenant très utilisés en sciences du vivant à la fois pour observer et étudier le vivant (microscopie, analyses de données, suivi de trajectoires...) mais aussi pour modéliser et comprendre les mécanismes physiques à l’origine des phénomènes biologiques. Le Master PFA-PV aborde les différentes échelles du vivant, de l’échelle moléculaire (ADN, membranes...) à l’échelle des populations (fourmis, poissons, humains...) en passant par l’échelle cellulaire (bactéries...) et des tissus biologiques (épithelium, sang...).

Le Master 1 se poursuit ensuite en Master 2 Physique pour le Vivant.
Pour plus d’informations voir le site dédié à l’adresse http://masterpcvs.ups-tlse.fr

 Responsable du module du M2 Physique du Vivant-Physique Fondamentale, Phénomènes hors-équilibre et processus irréversibles (Cours et TD avec N. Combe)

 Enseignant dans le module du M2 Physique du Vivant Biopolymères, biomembranes et physique de la particule unique.

 Responsable du module du M1 PV, Biophysique et matière molle (Cours et TD avec N. Destainville)

 Responsable du module du M2 Physique Fondamentale, Matière molle (Cours et TD avec E. Dantras)

 Responsable du module de Thermodynamique de Licence L2 Physique-PC-Spé Phys-Spé Chimie de l’UPS.
Cours magistral et travaux dirigés.

 Enseignant (physique statistique) à la Préparation à l’Agrégation de Physique de Toulouse

 Enseignant (physique statistique) aux M1 Physique fondamentale-Physique du Vivant-STUS (TD)

Mesoscopic Modeling in Physics of Molecular and Cell Biology

Toulouse, October 10th to 13th, 2016

Short Curriculum Vitae

Links/Collaborations

Statistical physics group (LPT, Toulouse)

Nicolas Destainville

John Palmeri

Functional dynamics of biological membranes and DNA molecules (IPBS, Toulouse), Laurence Salomé, Catherine Tardin

Genetic Recombination and the cell cycle (LMGM, Toulouse), Philippe Rousseau

Sébastien Balme

Fabien Picaud

Roland Netz

Mano perso