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Manoel Manghi

Manoel MANGHI




Maître de Conférences
Habilité à Diriger des Recherches
Section CNU 29
Université Toulouse III - Paul Sabatier



Contact : manghi[at]irsamc.ups-tlse.fr

Address : Laboratoire de Physique Théorique, IRSAMC, Université Paul Sabatier, 118 Route de Narbonne, 31062 Toulouse Cedex 4, France

Office : 326 Bâtiment 3R1B4

Phone : +33 (0)5 61 55 61 77

Fax : +33 (0)5 61 55 60 65


Please visit the new LPT website

Research Interests : Theoretical Soft Matter and Biophysics

For a complete list of my publications, follow this link.


- 

theory of charged complex liquids

  • adsorption of polyelectrolytes from semi-dilute solutions [15]
  • dependence of the persistence length of a flexible polyelectrolyte on the Debye length [9]
  • dielectric exclusion near surfaces and in nanopores [19,21,22,34]
  • liquid-vapor interface potential and ion solvation [25]
  • conductance through hydrophobic nanopores [30,36]
  • ANR project IONESCO Coupling between Ionic and Electronic Transport in Single-Walled Carbon Nanotubes

- 

modeling of biological phenomena

  • DNA denaturation [13,14,16,24] see highlight
  • DNA bubble closure/nucleation dynamics [23,26,28] see the Review [33]
  • statistical properties of DNA [17,24,32] see highlight
  • DNA in the Tethered Particle Motion geometry : dynamics, curvature and salt dependence [20,29,31] see highlight1 highlight2
  • biomimetism of flagellar hydrodynamics [10]
  • fluctuation induced interactions between lipid domains in membranes [12,27]
  • fluctuation induced interactions and hydrodynamics in double supported membranes [18]
  • effect of recycling on nano domain formation [35]
  • surface tension of biological membranes [37]

- 

low Reynolds number hydrodynamics

  • propulsion by a rotating elastic semi-flexible filament [10] see highlight
  • coupling between hydrodynamic interactions and elastic deformations [10,11]

- 

statistical physics of neutral polymers at interfaces

  • variational approach describing the statistical physics of loops formed by adsorbed polymers on solid and fluid interfaces [7,8]
  • variation of the surface tension of polymer melts and semi-dilute solutions vs. the polymerisation index. Comparison to experiments [1,2,4,5]
  • polymer brushes on concave surfaces [3]
  • polymer connectors mobile laterally [6]

My Google Scholar webpage

Highlights

- How salting DNA makes it more flexible and in french Comment saler l’adn le rend plus flexible
- Dependence of DNA Persistence Length on Ionic Strength of Solutions with Monovalent and Divalent Salts
- One of our recent articles [24] discussing DNA stretching by an applied force has been highlighted in epj.org.
- Why DNA denaturation bubble closure is so long ?
- Why DNA chains are "kinked" when observed on surfaces (DNA elastic properties on surfaces differ from ones in solution)
- DNA bubbles and bending : how conformational fluctuations modify its thermal denaturation
- How to reproduce bacterial propulsion in a biomimetic way ?

Thèse d’Habilitation à Diriger des Recherches (in french)
"Physique statistique d’objets biologiques et des électrolytes aux interfaces"

Ph.D. students

- Anil Kumar Dasanna (2010-2013) : currently in U. Schwarz group
Closure of DNA denaturation bubbles coupled to DNA elasticity
- Annaël Brunet (2012-2015) :Study of DNA conformational changes at the single molecule scale
- Guillaume Gueguen (2013-2016) : Lipidic vesicles under tension : from mesophases to shape transitions.
- Julie Cornet (2017-2020) : Numerical study of lipidic vesicles
- Théo Hennequin (2019-2023) : Coupling between Ionic and Electronic Transport in Single-Walled Carbon Nanotubes.
- Léa Costes (2022-2025) : Physical parameters underlying chromatin dynamics changes in response to transcription activation (with Kerstin Bystricky)


Administrative responsibilities/responsabilités administratives

- Membre élu du Comité national des Universités CNU section 29 - Constituants élémentaires (2019-2023 et 2023-2027)

- Membre élu de la Commission de la Recherche de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier (2019-2023 et 2023-2027)

- Membre du Conseil Académique de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier
- Vice-président de la Section Disciplinaire de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier (2019-2023 et 2023-2027)

- Membre de la Section Disciplinaire de l’Université Toulouse III - Paul Sabatier (2019-2023)


Teaching/Enseignement

- Responsable du

Master PFA-PMV (Physique Fondamentale et Applications - Parcours Physique et Mécanique du Vivant)


Ce Master a pour but de former des étudiants de haut niveau en biophysique, physico-chimie, matière molle, physique de l’imagerie, physique des comportements sociétaux afin qu’ils soient en mesure d’appréhender des problèmes de biologie avec les outils de la physique. Ceux-ci sont maintenant très utilisés en sciences du vivant à la fois pour observer et étudier le vivant (microscopie, analyses de données, suivi de trajectoires...) mais aussi pour modéliser et comprendre les mécanismes physiques à l’origine des phénomènes biologiques. Le Master PFA-PMV aborde les différentes échelles du vivant, de l’échelle moléculaire (ADN, membranes...) à l’échelle des populations (fourmis, poissons, humains...) en passant par l’échelle cellulaire (bactéries...) et des tissus biologiques (épithelium, sang...).

Le Master 1 se poursuit ensuite en Master 2 Physique pour le Vivant.

Pour plus d’informations voir le site dédié à l’adresse https://www.univ-tlse3.fr/decouvrir-nos-diplomes/master-parcours-physique-et-mecanique-du-vivant-pmv-1

"Plaquette de présentation"

"Diaporama de présentation"

- Responsable du module du M2 Physique Fondamentale (PFIQMC), Phénomènes critiques et transitions de phases (Cours-TD)

- Enseignant dans le module du M2 Physique et Mécanique du Vivant Biopolymères, biomembranes et physique de la particule unique (Cours et TD avec N. Destainville)

- Responsable des modules du M1 PMV, Biophysique 1 et Biophysique 2 (Cours et TD avec N. Destainville)

- Responsable du module du M1 Physique Fondamentale (PFIQMC) et M1 PMV, Matière molle (Cours et TD avec E. Dantras)

- Responsable du module de Physique Statistique (Licence Flexible 3ème année) de l’UT3.
Cours magistral.

- Responsable du module BioMIP 8 Physique (Licence 3 BioMIP) de l’UT3.
Cours-TD.

- Enseignant (physique statistique, hydrodynamique, leçon, écrits) à la Préparation à l’Agrégation de Physique de l’UT3>http://agreg.physchim.tlse.free.fr/...]

- Enseignant (Projets numériques) aux M1 PMV, PFIQMC et Agreg

- Enseignant (Outils mathématiques 1) aux L1 Licence Spéciale Physique (cours-TD)


Short Curriculum Vitae

2010 Habilitation à Diriger des Recherches
Theoretical Physics Laboratory, Paul Sabatier University, Toulouse
since 02/2005 Associate Professor/Maître de Conférences
Theoretical Physics Laboratory, Paul Sabatier University, Toulouse
09/2004-01/2005 CNRS posdoctoral position
Theoretical Physics and Astroparticles Laboratory, Montpellier
2002-2004 Postdoctoral position in Pr Netz group
Ludwig Maximilian University, Munich
Research Fellowship of the Alexander von Humboldt foundation
1999-2002 Ph.D. in theoretical physics : Theoretical contributions to the study of polymers at interfaces
Commissariat à l’Energie Atomique, DRFMC, SPrAM and Joseph Fourier University (Grenoble, 27 June 2002) supervised by M. Aubouy
1995-1999 Graduated from the École Normale Supérieure in Lyon
1998 Agrégation in physics

Links/Collaborations

Statistical physics group (LPT, Toulouse)

Nicolas Destainville

John Palmeri

Kerstin Bystricky

Functional dynamics of biological membranes and DNA molecules (IPBS, Toulouse), Laurence Salomé, Catherine Tardin

Genetic Recombination and the cell cycle (LMGM, Toulouse), Philippe Rousseau

Sébastien Balme

Fabien Picaud

Roland Netz

Mano perso